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染色质转座酶可及性测序(ATAC-seq)

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ATAC-seq (Assay for Transposase Accessible Chro-matin with high-throughput sequencing)是一种在全基因组范围内检测染色质的开放程度的组学技术,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息。

其原理是利用转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。该技术可用于分析开放的染色质区域上可能结合的潜在调控蛋白(如:转录因子和辅因子),用此方法与其他方法结合筛查感兴趣的特定调控因子。

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原文链接:Transposition_of_native_chromatin_for_fast_and_sensitive_epigenomic_profiling_of.pdf


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             Peak在TSS附近的分布                                                            Peak 中心信号分布图曲线图

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                Peak在染色体上的分布                                                            Peak在基因功能区的分布

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                      GO富集分析                                                                               KEGG富集分析

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 Motif分析                                                     ATAC-seq与RNA-seq联合分析Venn图

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